小沙冬青遗传多样性的RAPD分析
小沙冬青(Ammopiptanthus nanus(M.Pop.)Chengf.),也叫矮沙冬青、新疆沙冬青、矮黄花木,豆科(Leguminosae)沙冬青属(Ammopiptanthus)植物,分布区极其狭窄,在中国仅分布于新疆克孜勒苏克尔柯孜自治州乌恰县境内,是新疆特有的常绿灌木之一,被列为国家二级濒危保护植物,也是古老的第三纪残遗种,具有重要的研究价值。本文以来源于乌恰县境内自然分布的6个小沙冬青居群的120份样品为研究对象,研究了其RAPD-PCR反应条件,并应用RAPD分子标记对其遗传多样性水平和种群遗传结构进行了分析,结果表明:RAPD-PCR优化的最终体系为:20μl反应体系中:Mg2+2.5mmol/L,dNTPs0.15mmol/L,primer0.3μmol/L,DNA100ng/L,TaqDNA聚合酶2U。PCR扩增程序为:95℃变性2min;94℃变性40s,36℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环;72℃延伸10min。4℃保存。筛选得到的8条RAPD随机引物共检测出48条扩增DNA片段,其中多态性条带46条,多态性比率(PPB)为95.83%,平均每条引物检测到的位点数为8个,多态性位点数7.6个。Nei's基因多样性(H)值为0.3520,Shannon's信息多样性指数(I)值为0.5167,居群间遗传分化系数Gst为0.3296,表明小沙冬青的遗传变异主要存在居群内(67.04%)。基因流Nm为1.0170,6个居群的小沙冬青虽然在居群内有丰富的遗传变异,但居群之间已经产生了遗传变异和分化。根据RAPD扩增结果建立小沙冬青的UPGMA聚类图,所有居群在0.254处划分为两大类群,一支是吾合沙鲁居群和2个肖尔布拉克居群,另一支是康苏居群、巴音库鲁乡的阿合其居群和托帕尔居群。小沙冬青6个自然居群的遗传距离的分子聚类结果与其地理分布位置密切相关。
本文为焦培培, 张玲, 雍晓鹏,等. 小沙冬青遗传多样性的RAPD分析[C]// 生态文明建设中的植物学:现在与未来——中国植物学会第十五届会员代表大会暨八十周年学术年会论文集——第4分会场:资源植物学. 0.的摘要部分。